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質譜檢測的關鍵 | 蛋白內切酶

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01

蛋白質譜檢測
 

蛋白質是生物體中至關重要的分子,其結構和功能對于生命活動具有重要影響。蛋白質譜檢測作為一種先進的分析技術,為我們提供了深入了解蛋白質的工具。它不僅可以幫助我們鑒定和定量蛋白質樣品,還可以揭示蛋白質的結構、修飾和相互作用等信息,常見的質譜儀器主要有質譜質量分析儀(MS)和液相色譜(LC)等儀器,用于離子化、分離和檢測蛋白質樣品。

 

蛋白質質譜鑒定方法通常使用串聯質譜(MS/MS)和液相色譜-質譜聯用(LC-MS/MS)等方法,其中,簡單蛋白樣本用MS/MS,混合復雜蛋白樣本用LC-MS/MS。兩種方法作用原理相似:先將蛋白質利用蛋白酶消化成肽段,肽段在質譜儀中會離子化帶上一定量的電荷,離子檢測器可以鑒定各肽段的質荷比,從而獲知各肽段的相對分子質量;質譜儀會繼續打斷某些肽段再次分析,生成二級質譜,從而獲得肽段的序列信息;通過質譜數據庫比對分析,即可鑒定蛋白質。

 

 

蛋白質譜檢測主要有一下幾種應用,生物制品開發:蛋白質譜檢測在生物制品的研發過程中起著重要作用,可以幫助鑒定和驗證蛋白質產品的純度、結構和功能;生物標志物鑒定:通過蛋白質譜檢測,可以發現與特定疾病相關的生物標志物,為早期診斷和治療提供依據;藥物代謝研究:蛋白質譜檢測可用于研究藥物在體內的代謝過程,揭示藥物的藥代動力學和藥效學特征。

 

根據質譜檢測原理,我們可以知道蛋白樣本制備的過程至關重要,這決定了最終質譜結果的好與壞,而蛋白樣本制備的關鍵就在于蛋白內切酶的選擇了。

 

02
產 品 推 薦
 
  • Lysyl Endopeptidase®質譜級賴氨酰肽鏈內切酶

 

本產品是質譜分析前處理時常用的蛋白分解酶即賴氨酰肽鏈內切酶,該酶可以特異性切除賴氨酸基團C末端的多肽,可用于蛋白測序分析和Lys-X化合物的酶合成。若同時使用賴氨酰肽鏈內切酶和胰酶,可更好地切斷賴氨酸基團的多肽,增加多肽的數量。產品已按照使用習慣做成小包裝,是方便使用的冷凍干燥品。20 μg/支可用于100-200個樣品的凝膠內消化。

 

 PART.01 產品信息 
 
01
來源

細菌

02
外觀

凍干粉(包含2mmol/L Tris-HCl緩沖液,pH8)

03
活性

0.03~0.07 AU/vial

04
分子量

27,000(瓊脂糖過濾),30,000(SDS-PAGE)

05
溶解性

溶于水或緩沖液

06
穩定性

溶解于pH值5.0-12.0的Tris緩沖液中,可在4℃穩定保存2年;在pH值6.0-11.0、30℃時能穩定保存,但溫度超過50℃時不穩定。

07
最適pH值

9.0~9.5

08
等電點

6.9~7.0

09
底物特異性

可水解底物——Tos-Lys-OMe、Bz-Lys-NH2、Bz-Lys-pNA、Lys-pNA

 

不可水解底物——Bz-Arg-NH2、Bz-Arg-pNA、Arg-pNA

10
抑制劑

DFP、PMSF、TLCK

 

 
PART.02 產品特點
 
 

高特異性、高蛋白質消化率、適用于蛋白質譜分析

 

提高裂解效率、增加肽段數量

 

根據使用量特意制備小包裝,方便使用

 

03
應 用 實 例
 

分別采用胰蛋白酶(Tp)、賴氨酰肽鏈內切酶(Lys-C)和Tp與Lys-C 聯用進行膠內酶切的效果比較。

 

牛血清蛋白BSA的條帶(100 ng)通過SDS-PAGE獲得,然后分別用Tp、Lys-C 和 Lys-C+Tp進行酶切,再用MALDI-TOFMS法進行分析。這些蛋白酶的實驗效果見下表,這些結果表明Lys-C酶解的漏切位點數(Missed Cleavage)最少。Tp酶解時加入Lys-C后,漏切位點數有所降低,同時,可以鑒定出更多的多肽。

 

表1:Tp、Lys-C 和 Lys-C+Tp的結果對照

 

胰蛋白酶(Tp)(圖 a)和賴氨酰肽鏈內切酶(Lys-C)+Tp( 圖 b)

酶切后的質譜結果對照圖。

 

Lys-C+Tp酶切后,可以在m/z=2000時得到吸收峰,而單獨的Tp酶切在m/z=2000時沒有吸收峰。該結果表明 Lys-C 可以提高測序覆蓋度。

相 關 產 品 
 
 

125-05061

Lysyl Endopeptidase®, MS Grade 
賴氨酰肽鏈內切酶,MS

20μg×5

質譜級

121-05063

Lysyl Endopeptidase®, MS Grade 
賴氨酰肽鏈內切酶,MS

20μg

質譜級

050-05941

Endoproteinaseglu C, Sequencinggrade 

測序級谷氨酰蛋白內切酶Glu-C

50μg

生物化學分析級

202-15951

Trypsin, from Porcine Pancreas, Mass Spectrometrygrade 
豬胰腺胰蛋白酶質譜級別

20μg×5

質譜級

產品

名稱

                     處理體積

   規格

   級別

 

產品數據來源富士膠片和光(廣州)貿易有限公司 

http://labchem.fujifilm-wako.com.cn/pdf/show/152.html

 

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